สำนักงานเลขานุการกรม สังกัด กรมพัฒนาที่ดิน กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ ได้แบ่งส่วนราชการภายในออกเป็น 6 กลุ่มงาน ได้แก่ กลุ่มสารบรรณ กลุ่มนิติการ กลุ่มช่วยอำนวยการและประสานราชการ กลุ่มเผยแพร่และประชาสัมพันธ์ กลุ่มงานเลขานุการคณะกรรมการพัฒนาที่ดิน และกลุ่มงานพิพิธภัณฑ์ดิน